Wenn mehrere Eingänge aktiviert sind, startet EXO einen Abtastzyklus. EXO durchläuft nacheinander jeden Eingang, indem es jeweils Gas aus einem Eingang ansaugt und zwischen den einzelnen Proben eine Spülung durchführt. Während EXO sich selbst spült, treten Lücken in den Messwerten auf.

Aufgrund dieser Messlücken eignet sich ein Probenahmesystem mit mehreren Einlässen am besten für die Langzeitüberwachung abgelegener Gebiete.